MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl15

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011226	TTTTTA	2	12	59	70	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011226	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011226	TA	3	6	85	90	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011226	TA	3	6	111	116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011226	ATAC	2	8	145	152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011226	TA	3	6	224	229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011226	AAT	2	6	807	812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011226	T	6	6	3040	3045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011226	TAT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011226	AT	3	6	3079	3084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011226	T	7	7	3123	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011226	A	6	6	3133	3138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011226	ATATA	2	10	3208	3217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011226	AG	3	6	4984	4989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011226	ACT	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011226	TAG	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011226	C	6	6	5572	5577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_011226	ATT	2	6	5584	5589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011226	AGT	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011226	AAAT	2	8	5609	5616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011226	CAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011226	CTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011226	ATG	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011226	GTAA	2	8	6354	6361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011226	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011226	GATAA	2	10	6380	6389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011226	TG	3	6	6447	6452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011226	CAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011226	ATT	2	6	6552	6557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011226	TTA	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011226	T	6	6	6605	6610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011226	TAA	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011226	TA	3	6	9703	9708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011226	TAAC	2	8	9715	9722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011226	ATTTT	2	10	9787	9796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011226	TA	3	6	9805	9810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011226	TAG	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011226	TAC	2	6	9839	9844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011226	CTTAT	2	10	9845	9854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011226	TTAA	2	8	9880	9887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011226	T	6	6	9894	9899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011226	TTAA	2	8	9907	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011226	TTTA	2	8	9932	9939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011226	T	7	7	9975	9981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011226	ATTT	2	8	9984	9991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011226	T	6	6	9989	9994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011226	ATT	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011226	GT	3	6	10112	10117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011226	ATT	2	6	10140	10145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011226	T	6	6	10162	10167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011226	T	6	6	10184	10189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011226	TTAG	2	8	10227	10234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011226	AAAG	2	8	10243	10250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011226	TAG	2	6	10271	10276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011226	T	7	7	10302	10308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011226	A	8	8	10309	10316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011226	TAT	3	9	10330	10338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011226	TA	3	6	10340	10345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011226	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011226	T	7	7	10441	10447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011226	TTAAAA	2	12	10451	10462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011226	TAA	2	6	10471	10476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011226	AT	3	6	10483	10488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011226	A	7	7	10555	10561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011226	TAT	2	6	10572	10577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011226	T	7	7	10598	10604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011226	TAAAAT	2	12	10616	10627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011226	TTG	2	6	10685	10690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011226	AT	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011226	AAG	2	6	10734	10739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011226	AAAC	2	8	10745	10752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011226	AAG	2	6	10754	10759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011226	GTT	2	6	10830	10835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011226	AAT	2	6	10852	10857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011226	TATGT	2	10	10860	10869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011226	TTA	2	6	10882	10887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011226	AT	3	6	10888	10893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011226	TA	3	6	10973	10978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011226	AAC	2	6	10991	10996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011226	TAATT	2	10	11011	11020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011226	ATC	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011226	GTA	2	6	11064	11069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011226	GAA	2	6	11073	11078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011226	TGT	2	6	11156	11161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011226	T	6	6	11163	11168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011226	T	6	6	11208	11213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011226	A	6	6	11252	11257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011226	AGG	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011226	AGA	2	6	11268	11273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011226	ATA	2	6	12362	12367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011226	TTA	2	6	12450	12455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011226	TCAT	2	8	12485	12492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011226	ATTT	2	8	12507	12514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011226	T	7	7	12512	12518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011226	TTTG	2	8	12520	12527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011226	A	7	7	12540	12546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011226	AGG	2	6	12555	12560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011226	GAA	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011226	TAA	3	9	13289	13297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011226	AATA	2	8	13306	13313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011226	TTATGT	2	12	13345	13356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011226	GTTAA	2	10	13371	13380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011226	TTA	2	6	13420	13425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011226	G	7	7	13477	13483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011226	ATT	2	6	13484	13489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011226	T	8	8	13492	13499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011226	AAGA	2	8	13570	13577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011226	AGT	2	6	13597	13602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011226	TTTATA	2	12	13692	13703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011226	TGT	2	6	13776	13781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011226	ATTT	2	8	13795	13802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011226	T	6	6	13809	13814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011226	TTA	2	6	13816	13821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011226	AT	3	6	13833	13838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011226	ATTT	2	8	13852	13859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011226	TAT	2	6	13860	13865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011226	ATA	2	6	13884	13889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011226	A	6	6	13896	13901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011226	ATT	2	6	13936	13941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011226	A	6	6	14015	14020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011226	TAA	2	6	14095	14100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011226	ATC	2	6	14102	14107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011226	TA	3	6	14114	14119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011226	T	7	7	14124	14130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011226	GTTT	2	8	14155	14162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011226	T	6	6	14160	14165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011226	ATTTT	2	10	14173	14182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011226	T	6	6	14179	14184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011226	T	9	9	14190	14198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011226	A	7	7	14223	14229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011226	A	6	6	14231	14236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011226	AGG	2	6	14239	14244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011226	AGA	2	6	14247	14252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011226	A	6	6	14265	14270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011226	TAA	2	6	14290	14295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011226	TGA	4	12	14308	14319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011226	GGA	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011226	AGG	3	9	14357	14365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011226	GAG	2	6	14374	14379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011226	TGAG	2	8	14386	14393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011226	AAAG	2	8	14489	14496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011226	AGA	2	6	14549	14554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011226	AGA	2	6	14558	14563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011226	GGT	2	6	14586	14591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011226	TCA	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011226	A	6	6	14609	14614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011226	TTAA	2	8	14616	14623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011226	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011226	TAG	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011226	ATA	2	6	14866	14871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011226	AGG	2	6	14872	14877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011226	ATA	2	6	14899	14904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011226	ATC	2	6	14948	14953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011226	GAA	2	6	14964	14969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011226	GAA	2	6	14994	14999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011226	AGG	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011226	GAT	2	6	15030	15035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.